Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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HDAC1Q13547 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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HDAC1Q13547 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDAC1Q13547 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDAC1Q13547 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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