Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 GABRG3-204ENST00000554696 774 ntTSL 38.83□□□□□ -15e-7■■■■■ 29.9
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TARDBPQ13148 DLG5-207ENST00000475613 7246 ntTSL 512.14□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 29.9
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TARDBPQ13148 NFIA-214ENST00000496712 603 ntTSL 35.82□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 29.8
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TARDBPQ13148 PGM2-204ENST00000512556 2050 ntTSL 27.12□□□□□ -1.278e-8■■■■■ 29.8
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TARDBPQ13148 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.215e-8■■■■■ 29.8
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TARDBPQ13148 WDR26-205ENST00000479727 795 ntTSL 39.46□□□□□ -0.95e-8■■■■■ 29.8
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TARDBPQ13148 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-20■■■■■ 29.8
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TARDBPQ13148 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 29.8
TARDBPQ13148 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.574e-8■■■■■ 29.8
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TARDBPQ13148 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.385e-8■■■■■ 29.7
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TARDBPQ13148 ARL15-204ENST00000505630 628 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 29.7
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TARDBPQ13148 PYCR3-206ENST00000482616 830 ntTSL 222.42■■□□□ 1.186e-10■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.066e-10■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.746e-10■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.66e-10■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.236e-10■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 PYCR3-205ENST00000462036 579 ntTSL 413.85□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 58.7□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.782e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 29.7
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TARDBPQ13148 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 215.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 29.7
TARDBPQ13148 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 29.7
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TARDBPQ13148 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.369e-7■■■■■ 29.7
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