Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP53BP1Q12888 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP53BP1Q12888 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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