Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 SPC3YLR066W 555 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 YLR374CYLR374C 390 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 YIM1YMR152W 1098 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 YNL217WYNL217W 981 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 TEX1YNL253W 1269 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 YOR342CYOR342C 960 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 MFM1YPL060W 1242 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 PRP43YGL120C 2304 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 NOC4YPR144C 1659 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 GAD1YMR250W 1758 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 SAC1YKL212W 1872 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 CDC9YDL164C 2268 nt4.47□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 Q0255Q0255 1419 nt4.46□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 FMP30YPL103C 1407 nt4.46□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 PEX29YDR479C 1665 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ERG25YGR060W 930 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YHL044WYHL044W 708 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YJR012CYJR012C 624 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YKR047WYKR047W 306 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 NIT3YLR351C 876 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ELO3YLR372W 1038 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 HEK2YBL032W 1146 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CSM3YMR048W 954 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ARC40YBR234C 1155 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PRR2YDL214C 2100 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YER158CYER158C 1722 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CPS1YJL172W 1731 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 TFA1YKL028W 1449 nt4.46□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YDL124WYDL124W 939 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 DOS2YDR068W 933 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 GIC2YDR309C 1152 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 RIP1YEL024W 648 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YFR035CYFR035C 345 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 POL32YJR043C 1053 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 EMG1YLR186W 759 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ORM2YLR350W 651 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 BSD2YBR290W 966 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 Q0017Q0017 162 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 MSC2YDR205W 2175 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 MSE1YOL033W 1611 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CLF1YLR117C 2064 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PRM2YIL037C 1971 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 NOP58YOR310C 1536 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ADE6YGR061C 4077 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 SFI1YLL003W 2841 nt4.45□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YGR016WYGR016W 573 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YGR079WYGR079W 1113 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PFK1YGR240C 2964 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YIL152WYIL152W 708 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 FMP33YJL161W 543 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 LSO1YJR005C-A 282 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YAL066WYAL066W 309 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 SIC1YLR079W 855 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YML094C-AYML094C-A 402 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 FAR3YMR052W 615 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YBL062WYBL062W 381 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 BUD17YNR027W 954 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YNR042WYNR042W 429 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 SPO19YPL130W 672 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 snR19snR19 568 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PAH1YMR165C 2589 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt4.44□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 TCM62YBR044C 1719 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CDC48YDL126C 2508 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ENT1YDL161W 1365 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YCR050CYCR050C 309 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 RNH202YDR279W 1053 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 NAT2YGR147C 867 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 RSM26YJR101W 801 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CIN5YOR028C 888 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 GLO4YOR040W 858 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 AVT1YJR001W 1809 nt4.43□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PRP19YLL036C 1512 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CNA1YLR433C 1662 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CPR4YCR069W 957 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ATP6Q0085 780 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 SAE3YHR079C-A 276 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 FBP1YLR377C 1047 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 HLJ1YMR161W 675 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 TIF5YPR041W 1218 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 SOF1YLL011W 1470 nt4.42□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 EAR1YMR171C 1653 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 CDC6YJL194W 1542 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 HSE1YHL002W 1359 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 IMD2YHR216W 1572 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 ZRT1YGL255W 1131 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 RFC2YJR068W 1062 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 PCD1YLR151C 1023 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YAR061WYAR061W 204 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 SPS19YNL202W 879 nt4.41□□□□□ -1.7
UBX3Q12229 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms