Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YBL010CYBL010C 843 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RPL15BYMR121C 615 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RCM1YNL022C 1473 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 SIW14YNL032W 846 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 FRM2YCL026C-A 582 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YPS7YDR349C 1791 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 FRT2YAL028W 1587 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 DHH1YDL160C 1521 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 VPS73YGL104C 1461 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 EMP47YFL048C 1338 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 snR7-LsnR7-L 214 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 SLX8YER116C 825 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 SOL4YGR248W 768 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 SIP1YDR422C 2448 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 BUD5YCR038C 1929 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 PHO87YCR037C 2772 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RAD54YGL163C 2697 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 VPS45YGL095C 1734 nt3.56□□□□□ -1.84
USB1Q12208 KRE29YER038C 1395 nt3.55□□□□□ -1.84
USB1Q12208 UPC2YDR213W 2742 nt3.55□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YLR122CYLR122C 378 nt3.55□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YPL077CYPL077C 723 nt3.55□□□□□ -1.84
USB1Q12208 DSS4YPR017C 432 nt3.55□□□□□ -1.84
USB1Q12208 TOG1YER184C 2385 nt3.55□□□□□ -1.84
USB1Q12208 ZRC1YMR243C 1329 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 ELO2YCR034W 1044 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RPS11AYDR025W 471 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 API2YDR525W 330 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 LSB1YGR136W 726 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RTA1YGR213C 954 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YHR112CYHR112C 1137 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RPS4BYHR203C 786 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RPS4AYJR145C 786 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RPL14AYKL006W 417 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YNL181WYNL181W 1224 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 EFM2YBR271W 1260 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YPR003CYPR003C 2265 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 MIS1YBR084W 2928 nt3.54□□□□□ -1.84
USB1Q12208 TRK1YJL129C 3708 nt3.53□□□□□ -1.84
USB1Q12208 KIN2YLR096W 3444 nt3.53□□□□□ -1.84
USB1Q12208 CHL1YPL008W 2586 nt3.53□□□□□ -1.85
USB1Q12208 NHX1YDR456W 1902 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 TRF5YNL299W 1929 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ULS1YOR191W 4860 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 MRPL7YDR237W 879 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 SPO73YER046W 432 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 COX2Q0250 756 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YIR043CYIR043C 693 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YJR038CYJR038C 363 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 MMM1YLL006W 1281 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YOR289WYOR289W 756 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 INA17YPL099C 549 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YBR134WYBR134W 402 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 RSC58YLR033W 1509 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 FLC1YPL221W 2382 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 GRS2YPR081C 1857 nt3.52□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ATG2YNL242W 4779 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 MET17YLR303W 1335 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 TPA1YER049W 1935 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 SPC19YDR201W 498 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 BUD25YER014C-A 462 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 MIC26YGR235C 702 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 PRM9YAR031W 897 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 SEC72YLR292C 582 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 IBD2YNL164C 1056 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 SPN1YPR133C 1233 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YNR065CYNR065C 3351 nt3.51□□□□□ -1.85
USB1Q12208 SSH1YBR283C 1473 nt3.5□□□□□ -1.85
USB1Q12208 NBP2YDR162C 711 nt3.5□□□□□ -1.85
USB1Q12208 CSM2YIL132C 642 nt3.5□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ISA1YLL027W 753 nt3.5□□□□□ -1.85
USB1Q12208 MAL13YGR288W 1422 nt3.5□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ALO1YML086C 1581 nt3.5□□□□□ -1.85
USB1Q12208 PIC2YER053C 903 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 AIM22YJL046W 1230 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 MRPL3YMR024W 1173 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YBL059WYBL059W 582 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YPL014WYPL014W 1146 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YAR1YPL239W 603 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 RPO31YOR116C 4383 nt3.49□□□□□ -1.85
USB1Q12208 FMP10YER182W 735 nt3.48□□□□□ -1.85
USB1Q12208 RPS19AYOL121C 435 nt3.48□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YGK3YOL128C 1128 nt3.48□□□□□ -1.85
USB1Q12208 UBP10YNL186W 2379 nt3.48□□□□□ -1.85
USB1Q12208 RIA1YNL163C 3333 nt3.48□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ARH1YDR376W 1482 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 DIT2YDR402C 1470 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 EMC1YCL045C 2283 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YDR230WYDR230W 348 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 YGL193CYGL193C 312 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 PRE9YGR135W 777 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 RNA1YMR235C 1224 nt3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms