Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 MRK1YDL079C 1506 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 CRD1YDL142C 852 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 NUS1YDL193W 1128 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 TLG1YDR468C 675 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 CAB4YGR277C 918 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 PEX18YHR160C 852 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 YHR173CYHR173C 339 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 GLG2YJL137C 1143 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 PRE7YBL041W 726 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 YNR062CYNR062C 984 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 FIG1YBR040W 897 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 OXR1YPL196W 822 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 CIN2YPL241C 807 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 AMD1YML035C 2433 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 KEX2YNL238W 2445 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 GZF3YJL110C 1656 nt5.66□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 ARN2YHL047C 1863 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 RUB1YDR139C 234 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 COBQ0105 1158 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 YGL193CYGL193C 312 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 EFG1YGR271C-A 702 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 SVP26YHR181W 687 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 PPX1YHR201C 1194 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 YKL202WYKL202W 582 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 HMX1YLR205C 954 nt5.65□□□□□ -1.5
MCD1Q12158 APE3YBR286W 1614 nt5.65□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 VTH1YIL173W 4650 nt5.65□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 VTH2YJL222W 4650 nt5.65□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 ISN1YOR155C 1353 nt5.65□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 snR56snR56 88 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 NAT2YGR147C 867 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 CPR7YJR032W 1182 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 IMP2YMR035W 534 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 ATG12YBR217W 561 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 NTH2YBR001C 2343 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YIL001WYIL001W 1542 nt5.64□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YDR203WYDR203W 318 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 SNZ3YFL059W 897 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YJL028WYJL028W 336 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TVP38YKR088C 1014 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YMR085WYMR085W 1299 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YNL013CYNL013C 378 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 FMP41YNL168C 780 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 SNZ2YNL333W 897 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 RAS1YOR101W 930 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 ALG11YNL048W 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YDR109CYDR109C 2148 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TRM8YDL201W 861 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 LSM4YER112W 564 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 EMC4YGL231C 573 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 FOL2YGR267C 732 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 BAT2YJR148W 1131 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 DCN1YLR128W 810 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 snR37snR37 386 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TSL1YML100W 3297 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YGL176CYGL176C 1665 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 AFT1YGL071W 2073 nt5.62□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 UBC9YDL064W 474 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 IDP1YDL066W 1287 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 RPL13AYDL082W 600 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 DON1YDR273W 1098 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MPO1YGL010W 525 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YGR064WYGR064W 369 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 VMA22YHR060W 546 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MRPL49YJL096W 486 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MTC2YKL098W 1074 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 CTK1YKL139W 1587 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 PUF3YLL013C 2640 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 RUF22RUF22 515 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MID1YNL291C 1647 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 URK1YNR012W 1506 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 CUE5YOR042W 1236 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TFC7YOR110W 1308 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TRS33YOR115C 807 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YOR364WYOR364W 369 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 snR32snR32 188 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MRPL27YBR282W 441 nt5.61□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 ROG3YFR022W 2202 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TNA1YGR260W 1605 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 BI3Q0115 1554 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 SFB3YHR098C 2790 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 VPS38YLR360W 1320 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MDH3YDL078C 1032 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 GRX3YDR098C 858 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 MBR1YKL093W 1020 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 STM1YLR150W 822 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 RPS9AYPL081W 594 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YPR147CYPR147C 915 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 PWR1PWR1 941 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TUP1YCR084C 2142 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 ACS2YLR153C 2052 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 SNF3YDL194W 2655 nt5.6□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 NOP16YER002W 696 nt5.59□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.59□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 TYW3YGL050W 822 nt5.59□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 RPL27AYHR010W 411 nt5.59□□□□□ -1.51
MCD1Q12158 IKI1YHR187W 930 nt5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms