Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	GCR1	YPL075W	2358 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	NAM2	YLR382C	2685 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SRS2	YJL092W	3525 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	RRP1	YDR087C	837 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MMS2	YGL087C	414 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	TIP20	YGL145W	2106 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YHR112C	YHR112C	1137 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	NIS1	YNL078W	1224 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	RAD17	YOR368W	1206 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ECM23	YPL021W	564 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	HSP26	YBR072W	645 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	UGA3	YDL170W	1587 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	PPZ1	YML016C	2079 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	KRE29	YER038C	1395 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	DAS2	YDR020C	699 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YER076C	YER076C	909 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ELF1	YKL160W	438 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	PAM18	YLR008C	507 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	NRG2	YBR066C	663 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YPR071W	YPR071W	636 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ERG4	YGL012W	1422 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SWP82	YFL049W	1872 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MSN4	YKL062W	1893 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ACE2	YLR131C	2313 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SPR6	YER115C	576 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	COS4	YFL062W	1140 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	JAC1	YGL018C	555 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	RPS1B	YML063W	768 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	COS3	YML132W	1140 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	COS2	YBR302C	1140 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MAL13	YGR288W	1422 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	CLD1	YGR110W	1338 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YOL075C	YOL075C	3885 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	FLO8	YER109C	2400 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	KIP3	YGL216W	2418 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	THI22	YPR121W	1719 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	POL1	YNL102W	4407 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SLX8	YER116C	825 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YGL108C	YGL108C	423 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SPC34	YKR037C	888 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	FMP46	YKR049C	402 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	PSR1	YLL010C	1284 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	VPS68	YOL129W	555 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YNG1	YOR064C	660 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ICY2	YPL250C	411 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	VPS69	YPR087W	321 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SAS10	YDL153C	1833 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YAE1	YJR067C	426 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YKR075C	YKR075C	924 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	LDB18	YLL049W	540 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	HEK2	YBL032W	1146 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YNL143C	YNL143C	393 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ISA2	YPR067W	558 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	FKH1	YIL131C	1455 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	STV1	YMR054W	2673 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	SYF1	YDR416W	2580 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	ELO2	YCR034W	1044 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	PTC1	YDL006W	846 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MRPL7	YDR237W	879 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	FMP10	YER182W	735 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	DSD1	YGL196W	1287 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YLF2	YHL014C	1218 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	YPR059C	YPR059C	387 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	PHM7	YOL084W	2976 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	MET17	YLR303W	1335 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	DHH1	YDL160C	1521 nt		3.9	□□□□□ -1.78
VIK1	Q12045	RPC53	YDL150W	1269 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	AIR1	YIL079C	1083 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	EFB1	YAL003W	621 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YLL017W	YLL017W	312 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	YLR428C	YLR428C	345 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RGS2	YOR107W	930 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	MRPS9	YBR146W	837 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	DEG1	YFL001W	1329 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	ENT1	YDL161W	1365 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	SPC19	YDR201W	498 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	PRM9	YAR031W	897 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	IBD2	YNL164C	1056 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VIK1	Q12045	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.89	□□□□□ -1.79

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