Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CPSF1Q10570 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CPSF1Q10570 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
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