Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NIPAL4Q0D2K0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NIPAL4Q0D2K0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms