Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBBP4Q09028 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBBP4Q09028 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms