Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GOLGA3Q08378 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GOLGA3Q08378 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GOLGA3Q08378 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms