Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CXCL9Q07325 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CXCL9Q07325 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CXCL9Q07325 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms