Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNDQ07001 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNDQ07001 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms