Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNG1Q06432 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms