Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT17Q04695 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT17Q04695 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT17Q04695 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms