Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CFHR1Q03591 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CFHR1Q03591 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CFHR1Q03591 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CFHR1Q03591 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CFHR1Q03591 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CFHR1Q03591 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CFHR1Q03591 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms