Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PRCDQ00LT1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRCDQ00LT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms