Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLTCQ00610 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CLTCQ00610 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms