Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFAMQ00059 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFAMQ00059 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms