Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD3P84022 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMAD3P84022 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms