Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IRX3P78415 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IRX3P78415 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IRX3P78415 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IRX3P78415 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IRX3P78415 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IRX3P78415 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IRX3P78415 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IRX3P78415 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IRX3P78415 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX3P78415 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms