Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC4P56524 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC4P56524 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms