Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCL23P55773 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCL23P55773 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCL23P55773 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCL23P55773 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCL23P55773 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCL23P55773 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCL23P55773 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms