Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF10P55107 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF10P55107 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF10P55107 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF10P55107 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF10P55107 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF10P55107 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF10P55107 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF10P55107 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF10P55107 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms