Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPP55072 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPP55072 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPP55072 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPP55072 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPP55072 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPP55072 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPP55072 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPP55072 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPP55072 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPP55072 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPP55072 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPP55072 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPP55072 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCPP55072 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCPP55072 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCPP55072 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCPP55072 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms