Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DAP3P51398 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DAP3P51398 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DAP3P51398 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms