Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRE11P49959 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRE11P49959 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRE11P49959 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRE11P49959 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRE11P49959 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRE11P49959 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRE11P49959 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms