Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
RANGAP1P46060 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RANGAP1P46060 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms