Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL13AP40429 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPL13AP40429 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms