Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 IDS2YJL146W 1410 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 BRE4YDL231C 3378 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PRP19YLL036C 1512 nt3.84□□□□□ -1.8
DDI1P40087 CHL1YPL008W 2586 nt3.84□□□□□ -1.8
DDI1P40087 SRS2YJL092W 3525 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YGL193CYGL193C 312 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 TIM21YGR033C 720 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 CIA2YHR122W 696 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YBR016WYBR016W 387 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 RAD17YOR368W 1206 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 INA17YPL099C 549 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 snR37snR37 386 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 CLD1YGR110W 1338 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 BIK1YCL029C 1323 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MST1YKL194C 1389 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 SRP72YPL210C 1923 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 PRM2YIL037C 1971 nt3.83□□□□□ -1.8
DDI1P40087 ADP1YCR011C 3150 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 ACE2YLR131C 2313 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 ELO2YCR034W 1044 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MRP4YHL004W 1185 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 ECM34YHL043W 513 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 RFC2YJR068W 1062 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 SRP40YKR092C 1221 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 GAT3YLR013W 426 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 RPS31YLR167W 459 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YMR114CYMR114C 1107 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 POP3YNL282W 588 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 FEX1YOR390W 1128 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 FEX2YPL279C 1128 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 NCR1YPL006W 3513 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 STV1YMR054W 2673 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YER077CYER077C 2067 nt3.82□□□□□ -1.8
DDI1P40087 KIP3YGL216W 2418 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 GCR1YPL075W 2358 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YFR045WYFR045W 930 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YPR071WYPR071W 636 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 BSD2YBR290W 966 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 PRM1YNL279W 1986 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 PTA1YAL043C 2358 nt3.81□□□□□ -1.8
DDI1P40087 UGA3YDL170W 1587 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 CEG1YGL130W 1380 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 IDP2YLR174W 1239 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YPR015CYPR015C 744 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 TCM62YBR044C 1719 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 BOI2YER114C 3123 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MCM7YBR202W 2538 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MET12YPL023C 1974 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 NGL3YML118W 1518 nt3.8□□□□□ -1.8
DDI1P40087 BCH2YKR027W 2298 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MLH2YLR035C 2088 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YER076CYER076C 909 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YJL220WYJL220W 453 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YKR047WYKR047W 306 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 HEK2YBL032W 1146 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 NCE103YNL036W 666 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 RPS19AYOL121C 435 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 IDI1YPL117C 867 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 VPS69YPR087W 321 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 SIR1YKR101W 1965 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 SYF1YDR416W 2580 nt3.79□□□□□ -1.8
DDI1P40087 IOC2YLR095C 2439 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 HIS6YIL020C 786 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YIL152WYIL152W 708 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 EFB1YAL003W 621 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 FMP46YKR049C 402 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 UPS2YLR168C 693 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 YMR147WYMR147W 672 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 RPL18BYNL301C 561 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MGR2YPL098C 342 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 MRPS9YBR146W 837 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 PPZ1YML016C 2079 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 IOC4YMR044W 1428 nt3.78□□□□□ -1.8
DDI1P40087 ALG11YNL048W 1647 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 HCA4YJL033W 2313 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ARX1YDR101C 1782 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 UBP6YFR010W 1500 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RPP1AYDL081C 321 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YGR015CYGR015C 987 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 VPS71YML041C 843 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RNA1YMR235C 1224 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 NIS1YNL078W 1224 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 CMR3YPR013C 954 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RKM4YDR257C 1485 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 BCK2YER167W 2556 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 CNA1YLR433C 1662 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RPB2YOR151C 3675 nt3.77□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YGL140CYGL140C 3660 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 RDH54YBR073W 2877 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 COS7YDL248W 1152 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 COX2Q0250 756 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 MRS3YJL133W 945 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 COS5YJR161C 1152 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 PSR1YLL010C 1284 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 ECM23YPL021W 564 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 COA2YPL189C-A 207 nt3.76□□□□□ -1.81
DDI1P40087 FYV5YCL058C 459 nt3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms