Protein–RNA interactions for Protein: P38999

LYS9, Saccharopine dehydrogenase [NADP(+), L-glutamate-forming], yeast

Predictions only

Length 446 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYS9	P38999	YBR139W	YBR139W	1527 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	RPL28	YGL103W	450 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	Q0142	Q0142	177 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	HTD2	YHR067W	843 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	SOL3	YHR163W	750 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YLR346C	YLR346C	306 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	MDM12	YOL009C	816 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	AIM39	YOL053W	1188 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YOL106W	YOL106W	354 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	FEX1	YOR390W	1128 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	FEX2	YPL279C	1128 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	ATP20	YPR020W	348 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	NUP116	YMR047C	3342 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	MPH2	YDL247W	1830 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.99	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	NTH2	YBR001C	2343 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	UBA2	YDR390C	1911 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	TUP1	YCR084C	2142 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	UBC1	YDR177W	648 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YDR220C	YDR220C	294 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	RFA3	YJL173C	369 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	AAD10	YJR155W	867 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	RCN1	YKL159C	636 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	ATG33	YLR356W	594 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	REH1	YLR387C	1299 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	PNO1	YOR145C	825 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	NHP6A	YPR052C	282 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.98	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	RFT1	YBL020W	1725 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	ESC2	YDR363W	1371 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	ATP16	YDL004W	483 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	AIR2	YDL175C	1035 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	BTN2	YGR142W	1233 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	YNR042W	YNR042W	429 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	snR10	snR10	245 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	TRM13	YOL125W	1431 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	VHS2	YIL135C	1311 nt		4.97	□□□□□ -1.61
LYS9	P38999	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	TYR1	YBR166C	1359 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	GPM2	YDL021W	936 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YGR149W	YGR149W	1299 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YOR169C	YOR169C	465 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	SAS5	YOR213C	747 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	FDH1	YOR388C	1131 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	ARA1	YBR149W	1035 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	RPS9B	YBR189W	588 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	LDH1	YBR204C	1128 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	ESF1	YDR365C	1887 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	IMA1	YGR287C	1770 nt		4.96	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	APM2	YHL019C	1818 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	HPC2	YBR215W	1878 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YDL124W	YDL124W	939 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	GRX4	YER174C	735 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YKR070W	YKR070W	1059 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	APS1	YLR170C	471 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	ECM15	YBL001C	315 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	NBP1	YLR457C	960 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	IBD2	YNL164C	1056 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	PPG1	YNR032W	1107 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	LOA1	YPR139C	903 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	MKS1	YNL076W	1755 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	PUT1	YLR142W	1431 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	BUD7	YOR299W	2241 nt		4.95	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	TRM8	YDL201W	861 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	CTH1	YDR151C	978 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	VMA7	YGR020C	357 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YGR111W	YGR111W	1203 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YLL037W	YLL037W	381 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	BOS1	YLR078C	735 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	MIM2	YLR099W-A	264 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YMR010W	YMR010W	1218 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	TRS33	YOR115C	807 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	IRC13	YOR235W	315 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	HUA2	YOR284W	732 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	NCE102	YPR149W	522 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.94	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YER085C	YER085C	522 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YGL185C	YGL185C	1140 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	RPL24B	YGR148C	468 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	YAL069W	YAL069W	315 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	GAT3	YLR013W	426 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	SEC72	YLR292C	582 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	RIF2	YLR453C	1188 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	TPP1	YMR156C	717 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	PLP2	YOR281C	861 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.93	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.92	□□□□□ -1.62
LYS9	P38999	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.92	□□□□□ -1.62

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