Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX5P35711 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX5P35711 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX5P35711 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX5P35711 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX5P35711 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX5P35711 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SOX5P35711 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX5P35711 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX5P35711 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX5P35711 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOX5P35711 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOX5P35711 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOX5P35711 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX5P35711 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX5P35711 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX5P35711 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX5P35711 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX5P35711 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SOX5P35711 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOX5P35711 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOX5P35711 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms