Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSP1P33241 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSP1P33241 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSP1P33241 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSP1P33241 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSP1P33241 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSP1P33241 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSP1P33241 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms