Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DSG3P32926 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DSG3P32926 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DSG3P32926 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG3P32926 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG3P32926 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DSG3P32926 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DSG3P32926 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DSG3P32926 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DSG3P32926 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DSG3P32926 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms