Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC3AP31941 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC3AP31941 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms