Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5AP29375 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5AP29375 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5AP29375 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms