Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EPHA3P29320 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EPHA3P29320 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHA3P29320 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms