Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRR2P28476 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR2P28476 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR2P28476 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms