Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCM3P25205 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCM3P25205 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCM3P25205 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCM3P25205 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCM3P25205 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCM3P25205 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCM3P25205 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3P25205 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3P25205 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3P25205 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3P25205 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3P25205 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms