Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGCP20142 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGCP20142 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PGCP20142 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGCP20142 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGCP20142 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGCP20142 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGCP20142 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGCP20142 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PGCP20142 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGCP20142 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGCP20142 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGCP20142 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGCP20142 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms