Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATF3P18847 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATF3P18847 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATF3P18847 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATF3P18847 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATF3P18847 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATF3P18847 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ATF3P18847 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATF3P18847 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATF3P18847 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATF3P18847 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATF3P18847 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATF3P18847 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATF3P18847 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATF3P18847 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF3P18847 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF3P18847 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF3P18847 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF3P18847 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF3P18847 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATF3P18847 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATF3P18847 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATF3P18847 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF3P18847 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF3P18847 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATF3P18847 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms