Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EGR1P18146 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EGR1P18146 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EGR1P18146 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EGR1P18146 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms