Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEBPBP17676 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CEBPBP17676 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CEBPBP17676 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms