Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM27P14373 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM27P14373 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms