Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HLA-EP13747 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-EP13747 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-EP13747 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms