Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HARSP12081 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HARSP12081 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HARSP12081 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HARSP12081 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HARSP12081 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HARSP12081 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HARSP12081 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HARSP12081 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HARSP12081 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms