Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PYGBP11216 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGBP11216 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PYGBP11216 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYGBP11216 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYGBP11216 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYGBP11216 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYGBP11216 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYGBP11216 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYGBP11216 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PYGBP11216 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PYGBP11216 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYGBP11216 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYGBP11216 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYGBP11216 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYGBP11216 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms