Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRFP10586 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRFP10586 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRFP10586 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms