Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-30-3P0DP02 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-30-3P0DP02 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms