Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSH2P0DML3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSH2P0DML3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms